Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCAF6Q58WW2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms