Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ELF3-203ENST00000367284 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SERPINA10-204ENST00000554723 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ANKRD39Q53RE8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms