Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL38Q2WGJ6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms