Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC142Q17RM4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms