Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHQ16836 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHQ16836 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHQ16836 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHQ16836 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHQ16836 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HADHQ16836 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HADHQ16836 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms