Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NTRK2Q16620 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NTRK2Q16620 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NTRK2Q16620 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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NTRK2Q16620 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NTRK2Q16620 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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