Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms