Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ECM1Q16610 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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ECM1Q16610 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ECM1Q16610 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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