Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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PMCHL1Q16048 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL1Q16048 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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PMCHL1Q16048 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PMCHL1Q16048 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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