Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ZFHX3Q15911 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZFHX3Q15911 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms