Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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