Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SYCP1Q15431 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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