Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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LAPTM4AQ15012 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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LAPTM4AQ15012 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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LAPTM4AQ15012 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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LAPTM4AQ15012 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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LAPTM4AQ15012 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LAPTM4AQ15012 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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