Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SHPRHQ149N8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHPRHQ149N8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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