Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL19A1Q14993 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL19A1Q14993 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COL19A1Q14993 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COL19A1Q14993 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms