Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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CHD4Q14839 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHD4Q14839 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHD4Q14839 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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