Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAMC2Q13753 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms