Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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