Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RAB31Q13636 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms