Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms