Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TCOF1Q13428 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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