Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKAA1Q13131 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKAA1Q13131 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms