Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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CHAF1AQ13111 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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CHAF1AQ13111 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CHAF1AQ13111 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CHAF1AQ13111 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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CHAF1AQ13111 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CHAF1AQ13111 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHAF1AQ13111 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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