Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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IFT88Q13099 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFT88Q13099 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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