Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms