Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms