Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNA1Q09470 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms