Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms