Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms