Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms