Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms