Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD83Q01151 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD83Q01151 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD83Q01151 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD83Q01151 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD83Q01151 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD83Q01151 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms