Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms