Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms