Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX1P48742 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms