Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCLMP48507 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms