Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJA8P48165 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms