Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms