Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD4P46934 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms