Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIA1P42261 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIA1P42261 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GRIA1P42261 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms