Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMPOP42166 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms