Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARL4AP40617 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms