Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5C1P36542 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms