Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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