Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPHB2P29323 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms