Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms