Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJB2P29033 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GJB2P29033 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 511.2 ms