Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CA4P22748 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA4P22748 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA4P22748 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms