Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1673 ms