Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA4P13612 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms